Publicité en cours de chargement...
Dell déploie une architecture informatique Haute Performance (HPC) au service de la recherche contre le cancer à Gustave Roussy
« C’est de loin le projet le plus ambitieux que nous ayons réalisé avec Gustave Roussy, réputé pour traiter les cas rares de cancers et pour son expertise européenne en recherche médicale. En mettant les supercalculateurs de Dell au service de la recherche contre le cancer, nous allons pouvoir accélérer les processus de recherche en laboratoire afin de trouver des traitements adaptés à des cas jusqu’alors inconnus », déclare Marc Mendez-Bermond, HPC Solutions Expert, Dell.
Développé conjointement par les chercheurs de Gustave Roussy et les experts de Dell, ce projet informatique d’envergure s'appuie sur la puissance de calculs intensifs fournis par des équipements HPC et destiné à découvrir de nouvelles formes de cancers et à analyser leur impact en matière d'altération du génome, ainsi que leur évolution.
Les altérations du génome se caractérisent par une lésion cellulaire, qui provoque une mutation de l’ADN qui génère ensuite une protéine déficiente. S'ensuit une cascade d'événements qui peuvent aboutir à la formation d'une tumeur. Ainsi, l'objectif du groupe de travail de Gustave Roussy en charge de ces recherches était de pouvoir identifier rapidement les altérations du génome sur des tissus sains ou atteints, d'en extraire les séquences ADN et d’isoler les mutations, le tout dans un référentiel d'étude donné. Ce référentiel NGS (Next Generation Sequencing) repose sur un workflow d'analyse précis et nécessitant un équipement informatique conséquent afin d’analyser la masse de données produites.
« Le cancer commence toujours par une altération du génome, dûe à différents facteurs (pollution, UV, mode de vie, vieillissement, hérédité etc.). C’est sur ce cas précis que les systèmes Dell vont nous aider à optimiser la vitesse et l’efficacité des analyses de séquences d’ADN pour identifier les altérations génomiques », explique Daniel Gautheret, Professeur à l’Université Paris Sud.
Mis en service depuis 3 mois, le supercalculateur Dell de type Dell Genomic Data Analysis Plateform a permis d'analyser les séquences d'une vingtaine de tumeurs pédiatriques dans le cadre des essais cliniques BIOMEDE et MOSKIDO menés à Gustave Roussy par le Dr Grill et le Pr Soria, offrant de nouvelles perspectives de recherche.
La solution Dell au service du Big Data en cancérologie
Après avoir étudié les besoins et les limites techniques de ce projet, Dell a proposé à Gustave Roussy une gamme de solutions HPC complète, reposant sur des équipements serveurs, réseaux et stockage.
Tout au long du workflow NGS, permettant d’obtenir une cartographie de l’ADN, les opérations génèrent une très importante quantité de données. Disposées sur une solution de système de fichiers parallèle et basée sur des baies hautes performances Dell PowerVault MD d’une capacité totale de près de 220To, les données sont ensuite analysées, et des rapports d’analyses statistiques sont produits, fournissant les indications sur les mutations du génome.
La puissance de calcul nécessaire aux études est fournie par 16 serveurs Dell PowerEdge R630 et un serveur Dell PowerEdge R820, offrant une infrastructure haute performance facilitant l’accès, le traitement et la gestion des données génomiques volumineuses.
Le partenariat Dell, Gustave Roussy et la Fondation Gustave Roussy
Dell France et Gustave Roussy entrent dans la sixième année de leur partenariat technologique commencé en 2009, dans le cadre du programme mondial « Powering The Possible – Pediatric Cancer Care » de Dell. Depuis, Dell France soutient le Département de Cancérologie de l’Enfant & de l’Adolescent de Gustave Roussy dans le but d’améliorer la vie de ces patients, et de fournir un matériel informatique moderne à l’ensemble du corps médical.
L’architecture HPC de Dell installée à Gustave Roussy entre dans le cadre de ce partenariat.
La mobilisation de Dell pour la recherche sur le cancer pédiatrique ne s’arrête pas là. La structure philanthropique du groupe, Dell Global Giving, organise une opération inédite de mobilisation de ses employés pendant le mois de septembre. 98 000 personnes sont invitées à marcher, courir, pédaler pour soutenir la recherche sur le cancer des enfants. Dell contribue financièrement en faisant, pour chaque participant inscrit, un don qui sera reversé à trois institutions dans le monde qui œuvrent pour la génomique dont Gustave Roussy en Europe.
A propos de la Fondation Gustave Roussy
Créée en 2005, la Fondation Gustave Roussy a pour mission de financer la recherche menée à Gustave Roussy, tout en conservant au cœur de ses actions l'objectif d'améliorer la prise en charge et la qualité de vie des patients. La Fondation Gustave Roussy est agréée par le "Comité de la Charte du don en confiance" depuis juin 2009.
A propos de Gustave Roussy
Gustave Roussy, premier centre de lutte contre le cancer en Europe, constitue un pôle d’expertise global contre le cancer entièrement dédié aux patients. Il réunit 3 000 professionnels dont les missions sont le soin, la recherche et l’enseignement. – www.gustaveroussy.fr – www.gustaveroussy.fr/manifeste-innovationcancer
Avez-vous apprécié ce contenu ?
A lire également.

Vu à SantExpo 2025 : le CHU d’Amiens obtient l’accord officiel des archives départementales pour son Système d’Archivage Electronique avec la solution HYDMedia de Dedalus
26 mai 2025 - 15:41,
Actualité
- Pauline Nicolas, DSIHLors d’une session au sein de l’auditorium Dedalus, Jacques Delamarre, Responsable Parcours Patient au CHU d’Amiens a témoigné de la genèse qui a conduit à l’adoption de la solution SAE HYDMedia de Dedalus dans son établissement et des principaux apports de cette solution. Un SAE doit intégrer un l...

L’Académie de l’IA en santé de la FEHAP
26 mai 2025 - 11:27,
Actualité
- Damien Dubois, DSIHLe 21 mai 2025, lors de SantExpo, la FEHAP a annoncé le déploiement opérationnel de son plan d’actions pour son Académie de l’IA en santé.

CHU de Montpellier : « Pionnier de l’IA générative, notre hôpital traduit cette innovation dans toutes ses missions »
23 mai 2025 - 11:50,
Actualité
- Mathilde Debry, DSIHSantExpo 2025 – Paris. Le 22 mai, la directrice générale du CHU de Montpellier Anne Ferrer a détaillé dans une interview pourquoi et comment l’IA générative gagne progressivement toutes les strates de son établissement.

Vu à SantExpo 2025 | De l’international à la France : comment la donnée peut réinventer les systèmes d’information de santé – la vision de La Poste Santé & Autonomie et de ses partenaires
21 mai 2025 - 22:50,
Actualité
- Pauline Nicolas, DSIHDédiée à la transformation du système de santé à travers la data et comment la data peut réinventer le système d’information hospitalier, cette nouvelle agora se présente sous la forme d’un panorama en deux langues car tournée vers l’international. Entre exemple catalan et vision française d’un écos...